Apgūsti HPC lietošanu caur interaktīvu vidi – Galaxy – 14.-18. martā

Aicinām piedalīties bezmaksas Galaxy tiešsaistes kursā, kas norisināsies visas nedēļas garumā no 14. līdz 18. martam. 

Mācības, kura laikā tiks nodrošināts arī ekspertu atbalsts caur Slack kanālu (#event-tapas), notiks vienlaicīgi visā pasaulē. Lekcijas būs iepriekš ierakstītas, tādēļ tēmas katrs varēs apgūt sev vēlamā tempā. Lai iegūtu piekļuvi HPC resursiem Galaxy mācību nedēļas laikā, nepieciešams reģistrēties Galaxy kontam (skat. sadaļu Welcome & Setup) uz kāda no piedāvātajiem Galaxy serveriem.

Tāpat kā pagājušajā gadā, arī šogad Galaxy mācību nedēļas laikā būs iespēja apgūt daudzpusīgu un plašu programmu ar lekcijām un praktiskām nodarbībām, kas būs papildināta ar dažām jaunām tēmām:

  • Iepazīšanās ar Galaxy platformu;
  • RNS sekvenēšana;
  • Atsevišķu šūnu RNS;
  • Protemika;
  • Jaunums: SARS-CoV-2 genomika;
  • Jaunums: Mācības Galaxy administratoriem.

Pilna pasākuma programma pieejama šeit.

Sīkāka informācija par Galaxy mācību nedēļu pieejama šeit.

Reģistrēšanās.

Galaxy ir interneta platforma ne tikai biomedicīnas datu (piem., genoma, transkriptoma un proteoma) apstrādei, kas nodrošina plašu bioinformātikas rīku klāstu un ērtu lietošanu bez specifiskām Linux komandrindas un HPC sistēmu zināšanām. Šobrīd Galaxy tiek piedāvāta arī ekoloģijas un klimata pētīšanai, kā arī skaitļošanas ķīmijā. Mācības paredzētas gan tiem, kuri vēlas sākt darboties ar Galaxy, gan pieredzējušiem lietotājiem.

Arī uz RTU HPC skaitļošanas resursiem pieejama Galaxy platforma https://galaxy.hpc.rtu.lv, tāpēc šis kurss ir laba iespēja iepazīties ar Galaxy sniegtajām iespējām un ērtākajiem/piemērotākajiem rīkiem, lai to sāktu izmantot savā ikdienas pētnieciskajā vai studiju darbā. Par piekļuvi https://galaxy.hpc.rtu.lv lūdzam sazināties ar RTU HPC centru: hpc@rtu.lv.  

Jautājumu gadījumā rakstiet uz hpc@rtu.lv.

Mācības informatīvi atbalsta RTU HPC centrs un HPC kompetences centrs Latvijā EuroCC projekta ietvaros. 

 

Uzzināt vairāk par Galaxy