Šajā sadaļa ir apkopota HPC klasterī instalētā lietojumprogrammatūra, kas būs pieejama, kļūstot par klastera lietotāju (aizpildot pieteikumu) un pieslēdzoties klastera interfeisam (instrukcija ŠEIT). Ja katalogā neatrodat sev vajadzīgo programmatūru, tad sazinieties ar mums un izskatīsim tehniskās iespējas to instalēt. Lietotāji var arī paši instalēt (kompilēt) programmatūru savā lietotāja apgabalā.

Katalogs

Atvērtā koda

lietojumprogrammatūra

bcl2fastq (ver. 1.8.4)

Blender (ver. 2.7)

GROMACS (ver.2016-1)

OpenFoam (ver. 2.4, 5)

Peridigm (ver. 1.5)

R (ver. 3.4.0)

SalomeMerce (ver. 2015)

Scilab  (ver. 5.4)

Komerciālo izstrādātāju

lietotājprogrammatūra

COMSOL Multiphysics (ver. 5.3a)

MathWorks Matlab (ver. 2017b)

Programmēšanas

valodas/kompilatori/rīki 

Conda/Anaconda (ver. 4.4)

CUDA Toolkit (ver. 8.0)

GCC (ver. 4.8.5)

Intel MPI (ver. 4.0.3)

OpenMPI (ver. 1.10.5a)

Perl (ver. 5)

Python (ver. 2.7, 3.6)

R (ver. 3.4.0)

Klasterī tiek izmantoti moduļi (Environment Modules). Lai sagatavotu lietotāja darba vidi konkrētas programmatūras izmantošanai:

module load module_name

Iegūt pilnu pieejamo moduļu sarakstu:

module avail

Programmu palaišanas skriptu piemērus klasterim atradīsiet direktorijā:

/opt/exp_soft/user_info

Lai saņemtu individuālu palīdzību skripta izveidē, sazinieties ar HPC centru, rakstot e­pastu uz hpc@rtu.lv  .