Šajā sadaļa ir apkopota HPC klasterī instalētā lietojumprogrammatūra, kas būs pieejama, kļūstot par klastera lietotāju (aizpildot pieteikumu) un pieslēdzoties klastera interfeisam (instrukcija ŠEIT). Ja katalogā neatrodat sev vajadzīgo programmatūru, sazinieties ar mums, un mēs izskatīsim tehniskās iespējas to instalēt. Programmatūru savā lietotāja apgabalā Lietotāji var instalēt (kompilēt) arī paši.
Katalogs
Atvērtā koda
lietojumprogrammatūra
bcl2fastq (ver. 1.8.4)
Blender (ver. 2.7)
GROMACS (ver.2016-1)
Network Simulator 2 (ver. 2.34)
OpenFoam (ver. 2.4, 5)
Peridigm (ver. 1.5)
R (ver. 3.4.0)
SalomeMeca (ver. 2015)
Scilab (ver. 5.4)
Programmēšanas
valodas/kompilatori/rīki
Conda/Anaconda (ver. 4.4)
CUDA Toolkit (ver. 8.0)
GCC (ver. 4.8.5)
Intel Parallel Studio (ver. 2015)
Intel MPI (ver. 4.0.3)
OpenMPI (ver. 1.10.5a)
Perl (ver. 5)
Python (ver. 2.7, 3.6)
R (ver. 3.4.0)
Klasterī tiek izmantoti moduļi (Environment Modules). Lai sagatavotu lietotāja darba vidi konkrētas programmatūras izmantošanai:
module load module_name
Iegūt pilnu pieejamo moduļu sarakstu:
module avail
Programmu palaišanas skriptu piemērus klasterim atradīsiet direktorijā:
/opt/exp_soft/user_info
Lai saņemtu individuālu palīdzību skripta izveidē, sazinieties ar HPC centru, rakstot epastu uz hpc@rtu.lv .