Šajā sadaļa ir apkopota HPC klasterī instalētā lietojumprogrammatūra, kas būs pieejama, kļūstot par HPC lietotāju (aizpildot pieteikumu). Ja katalogā neatrodat sev vajadzīgo programmatūru, tad sazinieties ar mums un izskatīsim tehniskās iespējas to instalēt.

Lai saņemtu programmu palaišanas skriptu piemērus, sazinieties ar HPC centru, rakstot e­pastu uz hpc@rtu.lv

Katalogs

Zinātniskā

programmatūra

MathWorks MATLAB (ver. R2015a, R2015b, R2016a).

Scilab  (ver. 5.4)

NAMD (ver. 2.9)

GAMESS (ver. March 2012)

GROMACS (ver. 4.6.3)

OpenFoam (ver. 2.4.0)

Peridigm (ver. 14.1)

Blender (ver. 2.7)

Programmēšanas valodas/kompilatori/rīki

GCC C++ (ver. 4.4.7)

GCC gfortran (ver. 4.4.7)

GCC java (ver. 4.4.7)

GNAT GCC Ada (ver. 4.4.7)

Perl (ver. 5.10.1)

CUDA Toolkit (ver. 7.0 un 7.5)

Python (ver. 2.6 un 2.7.5)

MPI

bibliotēkas

OpenMPI (ver. 1.10.3)

mvapich2 (ver. 2.2a)

Intel MPI (ver. 4.0.3)

MATLAB (MDCS)

MATLAB Distributed Computing Server (MDCS) virtuāli paplašina MATLAB programmai pieejamos skaitļošanas resursus (CPU skaitu, atmiņu, vietu diskā), novirzot uzdevumu izpildi uz HPC klasteri. Divas unikālas MDCS īpašības:

  • piekļuve MATLAB izpildes instancēm uz klastera (workers) tiešā veidā no MATLAB interfeisa, lietojot Parallel Computing Toolbox sintaksi;
  • iebūvēta komunikācijas infrastruktūra starp izpildes instancēm: iebūvēts dalīto masīvu (distributed arrays) un ziņojumu apmaiņas (message passing) atbalsts.

Intel Parallel Studio

Programmatūras pakotnes Intel Parallel Studio pamatlietojums ir paralēlo programmu izstrāde augstas veiktspējas skaitļošanas sistēmām (HPC).

Rīki ir izmantojami ne tikai HPC programmu izstrādē, bet arī var palīdzēt ātrdarbīgāku programmu izstrādē personālajam datoram. Piemēram, Intel C++, Fortran kompilatori, kā arī Intel MKL matemātikas bibliotēkas tiek plaši izmantotas ne tikai paralēlo, bet arī seriālo programmu izstrādē, turklāt tās ir optimizētas tieši Intel procesoriem.

CUDA

CUDA ir programmēšanas modelis Nvidia grafiskajiem paātrinātājiem (GPU). HPC klasteris ir aprīkots ar sešiem Tesla M2070 un astoņiem Tesla K40 GPU. CUDA C++/Fortran programmēšanas bibliotēkas pieejamas, pieslēdzoties RTU HPC klastera piekļuves serverim (instrukcija).